Avec la dégradation inéluctable de la situation militaire depuis le début de 1941, toutes les bases Italiennes sont perdues les unes après les autres. Seule la base de Gondar reste réellement active avec 3 Squadriglia de CR 32 et 1 unité de transport équipée de Ca 133. En raison des difficultés d'approvisionnement en munitions dans le secteur, Mottet fait modifier son CR 42 en montant une Mitrailleuse de 7,7 à la place de l'une des deux mitrailleuses de 12,7 habituellement montée sur l'appareil.

Le 9 juillet, 5 Wellesleys du Squadron 47 attaquent Gondar. Mottet intercepte seul le raid et revendique la destruction de l'un des bombardiers. En fait, seul un bombardier est légèrement endommagé. Dans un rapport émanant de la 411a Squadriglia et daté du 11 août, Mottet indiquait alors qu'il totalisait 160 heures de vol de guerre depuis le 22 août 1939.

Le 15 Octobre, Mottet est promu Maresciallo (Aspirant) à Gondar. A partir du 31 octobre , après la mort de son commandant d'unité, le Tenente Malavolti, il devient le dernier pilote de chasse Italien encore présent en Afrique de l'Est. Le 22 novembre 1941, le dernier Fiat CR.42 (MM4033) en Afrique de l'Ouest, piloté par Mottet se lance à l'attaque de pièces d'artillerie dans le secteur de Kulkaber. Le Lieutenant Colonel Ormsby, le commandant de l'unité est tué lors du mitraillage.

Il s'agissait là de la dernière sortie de la Regia Aeronautica au cours de la Campagne d'Afrique de l'Est. Après avoir atterrit, Mottet met le feu à son appareil et se joint aux troupes au sol, combattant jusqu'à la rédition qui intervient 5 jours plus tard. Au cours de cette période passée en Afrique de l'Est, Mottet se sera vu décerner la Medaglia d'argento al Valore Militare.

Lorsque la guerre prend fin, en 1945, Giuseppe Mottet sera libéré et demandera à réintégrer les Forces Aériennes Italiennes. Il sera accepté et sera promu Flight Lieutenant et affecté à la l'Ecole de l'Air de Lecce où il vole sur Macchi C.205. En 1948, il est promu Captain et affecté au 5o Stormo Caccia à Vicenza, équipé avec des Spitfire Mk.IX.

Il tente alors de ramener l'appareil qui laisse trainer de la fumée à sa base mais alors qu'il amorçe son dernier virage, le moteur coupe et Giuseppe Mottet doit tenter un atterrissage forcé. Malheureusement, une aile touche les arbres et le Spitfire s'écrase. Giuseppe Mottet est sorti vivant de la carcasse mais il succombera à ses blessures quelques heures plus tard.

Au cours de sa carrière il aura aussi reçu une Medaglia di bronzo al Valore Militare et une Medaglie d'argento al Valore Aeronautico.